解放初南宙村屬江涇、新民、新橋3個行政村管轄。
1953年12月從江涇、新民2個村析出設南宙代表區(qū)，因境內有南字圩，宙字圩，故名南宙。
又從新橋村析出設三元代表區(qū)。
1954年由三元、南宙及長生村的新立3個代表區(qū)組成5個初級社。
1956年8月與新明、江涇等12個初級社合并建立飛輪高級社。
1958年10月屬干窯公社第十大隊（營）。
1959年4月為干窯管理區(qū)飛輪生產隊。
1961年4月析建新明、江涇、南宙3個大隊。
1984年1月各由大隊改為村。
1995年11月漁民村并入。