1951年，屬第三行政區(qū)，為巴溝鄉(xiāng)和卡力崗鄉(xiāng)。
1953年，由同德藏族自治區(qū)改為同德縣以后，巴溝為當(dāng)時同德下設(shè)6區(qū)中的一區(qū)。
1956年10月至1957年底，重編為第五區(qū)（巴溝）。
1958年3月，撤區(qū)并鄉(xiāng)時巴溝、卡力崗合并為巴溝鄉(xiāng)，同年10月，改巴溝鄉(xiāng)公社。
1963年，分為松多、巴溝、卡力崗3個農(nóng)業(yè)公社。
1965年，將原有的卡力崗公社、松多公社、巴溝公社合并為巴溝鄉(xiāng)。
1970年，改為巴溝人民公社。
1984年4月，復(fù)為巴溝鄉(xiāng)。