康巴什，蒙古語意為“卓越的老師”。
夏朝時期，康巴什為熏育部落活動的地區(qū)。
商朝時期，為鬼方等部族的游牧之地。
西周時期，成為嚴狁之牧境。
春秋初期，被林胡等部族占據(jù)。
秦始皇三十二年（前215年），秦始皇派大將蒙恬領(lǐng)兵30萬，北擊匈奴，占據(jù)黃河以南地，區(qū)境全部屬秦上郡。
秦末，匈奴又復(fù)南下，今區(qū)境為匈奴駐牧地。
漢武帝元朔二年（前127年），區(qū)境歸漢所轄。
漢武帝元朔四年（前125年），設(shè)西河郡，區(qū)境屬西河郡轄地。
東漢光武帝建武五年（29年），地方首領(lǐng)盧芳占據(jù)五原、朔方、云中、定襄、雁門等郡，區(qū)境屬其所轄。
光武帝建武十六年（40年），盧芳北逃匈奴，區(qū)境復(fù)歸東漢西河郡。
光武帝建武二十年（44年），南匈奴投靠漢王朝，區(qū)境并進入西河郡。
東漢永和五年（140年），西河郡治所由平定遷至離石，區(qū)境成為南匈奴牧地。
西晉元康五年（295年），鮮卑族拓跋猜盧出兵擊敗匈奴，今區(qū)境被拓跋部所據(jù)。
西晉永嘉四年（310年），匈奴鐵弗部劉虎由晉北遷居境內(nèi)，并歸前趙，今區(qū)境成為前趙轄地。
后趙石勒元年（319年），今區(qū)境屬后趙朔州地。
前秦建元元年（365年），今區(qū)境為前秦所轄。
北魏登國六年（391年），今區(qū)境歸北魏所轄，后為后秦轄地。
北魏天賜四年（407年），今區(qū)境為赫連勃勃大夏幽州代來城轄地。
北魏始光四年（427年），今區(qū)境復(fù)魏。
北魏孝文帝太和十一年（487年），北魏置夏州，今區(qū)歸北魏統(tǒng)轄。
北魏永熙三年（534年），北魏分裂為東魏和西魏，今區(qū)境屬西魏夏州化政郡。
北周孝閔帝元年（557年），西魏被北周取代，今區(qū)境屬北周夏州弘化郡。
隋開皇三年（583年），境內(nèi)屬其管轄。
隋開皇七年（587年），置榆林縣，今區(qū)境東部為云州榆林縣轄地。
隋開皇十年（590年），置富昌縣，今區(qū)境為云州富昌縣所轄。
隋開皇二十年（600年），隋劃云州的榆林、富昌、金河3縣設(shè)置勝州，今區(qū)境屬勝州富昌縣。
隋大業(yè)三年（607年），改勝州為榆林郡，今區(qū)境屬榆林郡富昌縣。
唐貞觀三年（629年），今區(qū)境屬勝州。
唐天寶元年（742年），將勝州改為榆林郡，轄榆林、河濱2縣，今區(qū)境屬河濱縣。
唐乾元元年（758年），將榆林郡復(fù)改為勝州，今區(qū)境屬勝州河濱縣。
遼神冊元年（916年），今區(qū)境東部歸契丹所有。
宋景德二年（1005年），今區(qū)境西部屬于黨項領(lǐng)有的夏州。
西夏元德八年（1126年），今區(qū)境全部為西夏所據(jù)。
蒙古（元）太祖二十一年（1226年），成吉思汗親自率軍征伐西夏，今區(qū)境為蒙古轄地。
元至元八年（1271年），蒙古改國號為元，今區(qū)境屬元中書省河?xùn)|山西道宣慰司大同路東勝州。
明洪武四年（1371年），今區(qū)境屬五花城千戶所。
明洪武二十五年（1392年），今區(qū)境為東勝右衛(wèi)轄地。
明永樂元年（1403年），今區(qū)境被蒙古部所據(jù)。
后金（清）天聰九年（1635年），今區(qū)境為后金藩屬地。
清順治六年（1649年），清廷由六個旗組建伊克昭盟，今區(qū)境大部屬于其中的鄂爾多斯左翼中旗（郡王旗）扎薩克牧地。
清乾隆元年（1736年），從烏審旗將近族臺吉的平民分為十三個蘇木，劃撥土地，組成鄂爾多斯右翼前末旗（即札薩克旗），今區(qū)境（哈巴格希）歸屬札薩克旗。
民國時期，清廷對待蒙古實行的種種政策繼續(xù)生效，今區(qū)境屬伊克昭盟郡王旗第六保和第七保管轄。
1949年10月1日，中華人民共和國成立后，今區(qū)境屬伊克昭盟郡王旗二區(qū)、三區(qū)管理。
1958年，郡王旗與扎薩克旗合并為伊金霍洛旗，康巴什和紅海子鄉(xiāng)合并成立先鋒人民公社。
1959年，伊金霍洛旗調(diào)整人民公社范圍，先鋒人民公社改稱為紅海子人民公社。
2000年12月，經(jīng)內(nèi)蒙古自治區(qū)人民政府批準，在哈巴格希鄉(xiāng)境內(nèi)成立自治區(qū)級經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)—青春山經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)。
2001年1月，成立伊克昭盟青春山經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)管理委員會，為盟公署派出機構(gòu)，正處級單位。
2001年4月，伊克昭盟經(jīng)國務(wù)院批準，撤盟設(shè)鄂爾多斯市，哈巴格希鄉(xiāng)仍歸屬伊金霍洛旗。
2001年9月，隨撤盟設(shè)市，伊克昭盟青春山經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)更名為鄂爾多斯市青春山經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)。
2003年7月，經(jīng)內(nèi)蒙古自治區(qū)人民政府批準，將伊金霍洛旗的哈巴格希鄉(xiāng)整建制劃入東勝區(qū)管轄。
2004年4月，經(jīng)內(nèi)蒙古自治區(qū)人民政府批準，鄂爾多斯市青春山經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)更名為鄂爾多斯市東勝康巴什新區(qū)，鄂爾多斯市青春山經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)管理委員會相應(yīng)更名為鄂爾多斯市東勝康巴什新區(qū)管理委員會。
2006年7月，鄂爾多斯市人民政府遷址入駐康巴什新區(qū)。
2008年6月，鄂爾多斯市人民政府同意將東勝康巴什新區(qū)管理體制比照旗區(qū)對待。
2008年9月，鄂爾多斯市人民政府批準將東勝康巴什新區(qū)更名為康巴什新區(qū)。
2008年12月，鄂爾多斯市人民政府第八次常務(wù)會議紀要明確將東勝區(qū)哈巴格希鄉(xiāng)整建制交由康巴什新區(qū)代管，康巴什新區(qū)與伊金霍洛旗暫以烏蘭木倫河為界。
2016年6月8日，國務(wù)院正式批準設(shè)立鄂爾多斯市康巴什區(qū)，成為內(nèi)蒙古自治區(qū)第103個縣級行政區(qū)。
2017年12月12日，鄂爾多斯市康巴什區(qū)人民政府正式掛牌成立。