秦漢時期，北方多戰(zhàn)亂、饑荒，河南、山西、山東、河北農民南遷流往荊襄，荊襄流民沿漢江、堵河尋求生存之地，陸續(xù)定在于此地，開山辟地，櫵采而食生存繁衍。
后居民在此開始在此地農耕，“插木為標，挽草為記”，標注自己開墾的范圍；民國20年（1931年）賀龍率紅三軍來房縣，開辟革命根據(jù)地后，指北村隸屬下店二區(qū)蘇維埃政府管轄；民國21年（1932年）舊政權復辟，民國政府設立一區(qū)；民國23年，指北村由一區(qū)管轄的軍店鎮(zhèn)管轄；1949年8月，房縣解放，指北村由軍店區(qū)管轄；1952年8月7日，成立指北鄉(xiāng)，隸屬二區(qū)管轄；1956年，指北村隸屬軍店區(qū)管轄；1958年11月11日，根據(jù)中共中央關于建立農村人民公社的決定，指北村更名為指北大隊，由軍店公社管轄；1964年底，指北村屬軍店區(qū)管轄；1984年，成立指北村村民委員會，隸屬軍店鎮(zhèn)管轄至今；2001年洞子并入指北村；2005年，白果村并入指北村，沿用指北村村民委員會至今。