1958年公社時代，取名營盤頭大隊。
1982年10月31日，全縣行政區(qū)劃調(diào)整，營盤頭大隊屬許家壩區(qū)三溪公社管轄。
1984年全縣行政區(qū)劃再次調(diào)整，營盤頭大隊更名為水車壩村，屬許家壩區(qū)三溪鄉(xiāng)管轄。
1992年2月，貴州省人民政府批準思南縣進行“建鎮(zhèn)并鄉(xiāng)撤區(qū)”工作，建立許家壩鎮(zhèn)，水車壩村屬許家壩鎮(zhèn)管轄。
2007年4月，縣人民政府下達《關(guān)于撤小村并大村整合的批復(fù)》，水車壩村并入馬畔塘村，屬許家壩鎮(zhèn)管轄。
2010年11月16日，思南縣人民政府批準調(diào)整全縣行政區(qū)劃，恢復(fù)水車壩村，屬許家壩鎮(zhèn)管轄。