1949年10月，玉樹村屬番禺縣。
1953年6月，玉樹屬廣州市黃埔區(qū)。
1955年6月，玉樹屬廣州市郊區(qū)黃村鄉(xiāng)。
1958年2月，玉樹屬廣州市郊區(qū)東圃人民公社管轄。
1964年，玉樹村劃歸郊區(qū)知青農(nóng)場。
1969年，玉樹村由廣州市郊區(qū)劃入越秀區(qū)管轄。
1971年，玉樹村屬農(nóng)場局領(lǐng)導(dǎo)下的新塘農(nóng)工商聯(lián)合公司。
2000年9月，玉樹村劃屬廣州市天河區(qū)東圃鎮(zhèn)。
2002年底，廣州市天河區(qū)東圃鎮(zhèn)撤鎮(zhèn)設(shè)街，玉樹村劃歸天河區(qū)新塘街。
2003年1月，玉樹村由天河區(qū)新塘街劃屬廣州經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)夏港街。
2004年5月26日，廣州開發(fā)區(qū)聯(lián)和街辦事處成立，玉樹村由開發(fā)區(qū)夏港街劃歸聯(lián)和街管轄。
2005年5月，玉樹村完成“村改居”，成立玉樹社區(qū)居民委員會，2014年，改屬黃埔區(qū)并沿用至今。