古屬潮陽縣新興鄉(xiāng)，明、清至民國初屬洋烏都。
民國十年（1921年），屬第九區(qū)。
1952年8月，改為第十區(qū)。
1956年12月，撤區(qū)建鄉(xiāng)，陳店區(qū)分為仙城、深溪、陳店、石橋頭、大長隴5個大鄉(xiāng)。
1957年11月，分為陳店大鄉(xiāng)，轄金溪鄉(xiāng)、大長隴鄉(xiāng)。
1958年5月，大長隴鄉(xiāng)（汕柄村除外）以及陳店鄉(xiāng)的石港村劃歸普寧縣。
1958年9月，陳店鄉(xiāng)建立東風(fēng)公社。
1959年，更名為陳店公社。
1961年10月，陳店公社析出仙城。
1983年12月，改稱陳店區(qū)。
1986年11月，改為陳店鎮(zhèn)。