1949年文縣解放,1951年全縣調(diào)整為6區(qū)46鄉(xiāng),屬碧口區(qū)肖家鄉(xiāng)轄。
1955年10月合并區(qū)、鄉(xiāng)機(jī)構(gòu)后,仍屬碧口區(qū)肖家鄉(xiāng)轄。
1958年12月成立碧口公社,為碧口公社磨河壩大隊(duì)。
1961年公社劃小,為肖家公社磨河壩大隊(duì)。
1983年10月肖家公社改為肖家鄉(xiāng),為肖家鄉(xiāng)磨河壩大隊(duì)。
1984年改為肖家鄉(xiāng)磨河壩村,村下建合作社。
1986年設(shè)立磨河壩村村民委員會(huì),所屬合作社改稱村民小組。
2004年撤銷肖家鄉(xiāng)后劃歸碧口鎮(zhèn)轄。