成立于1953年，行政區(qū)劃調(diào)整后，稱張掖縣梁家墩鄉(xiāng)清涼寺大隊(duì)，1958年撤縣建市，稱張掖市梁家墩鄉(xiāng)清涼寺大隊(duì)，1961年恢復(fù)張掖縣，稱張掖縣梁家墩鄉(xiāng)清涼寺大隊(duì)。
1962年改為梁家墩公社清涼寺大隊(duì)，1967年文革期間更名為先鋒公社清涼寺大隊(duì)，1970年6月恢復(fù)為梁家墩公社清涼寺大隊(duì)。
1983年11月更名為梁家墩鄉(xiāng)清涼寺村民委員會(huì)，1997年10月撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，稱張掖市梁家墩鎮(zhèn)清涼寺村民委員會(huì)，2002年7月張掖市撤市成立甘州區(qū)，更名為甘州區(qū)梁家墩鎮(zhèn)清涼寺村民委員會(huì)至今。