據(jù)《寰宇記》載，武隆在春秋時(shí)期，縣境屬于巴國(guó)領(lǐng)地。
楚威王時(shí)（339～329）置黔中郡，武隆縣境隸屬黔中地。
至漢代，武帝置涪陵縣于今彭水縣境。
縣境大溪河以東為巴郡涪陵縣地，以西部分則屬于巴郡枳縣。
蜀漢時(shí)期，武隆大部分地區(qū)隸屬巴郡涪陵縣，小部分（現(xiàn)江口鎮(zhèn)一帶屬黔安郡彭水縣。
唐武德二年（619），分涪陵縣一部設(shè)置武龍縣，治地在今土坎鎮(zhèn)，隸屬于涪州。
宋宣和元年（1119），武龍縣改稱(chēng)為枳縣。
紹興元年（1131），恢復(fù)武龍縣，仍隸屬于涪州。
明洪武十年（公元1377），因與廣西省一縣同名，故改“龍”為“隆”，更名為武隆縣，仍隸屬于涪州。
清康熙七年（公元1668），原治地設(shè)置鎮(zhèn)，設(shè)武隆巡檢司。
嘉慶七年（1802），武隆巡檢司改為分州。
民國(guó)二年（1913）2月，涪州改為涪陵縣。
武隆分州稱(chēng)武隆分縣。
1930年6月，涪陵全縣劃分為21個(gè)區(qū)，武隆大部分地區(qū)屬笫十六區(qū)至二十一區(qū)。
1931年6月，涪陵21個(gè)區(qū)合并為10個(gè)區(qū)，今武隆大部分屬八、九、十區(qū)。
區(qū)署分設(shè)在永順鎮(zhèn)（現(xiàn)在的長(zhǎng)壩鎮(zhèn)）、羊角磧（現(xiàn)在的羊角鎮(zhèn)）、火爐鋪（現(xiàn)在的火爐鎮(zhèn)）。
1935年5月，八、九、十區(qū)合并為涪陵第五區(qū)，區(qū)治地設(shè)在羊角磧。
1942年7月，涪陵分出笫五區(qū)，建立武隆設(shè)治局，隸屬于四川省第八行政督察署。
1945年1月，武隆設(shè)治局升格為武隆縣。
新中國(guó)成立后，武隆縣于1949年12月成立人民政府，駐地在巷口鎮(zhèn)，隸屬川東涪陵區(qū)行政專(zhuān)員公署。
1953年10月，彭水縣笫三區(qū)（今江口、石橋、文復(fù)、浩口）劃屬武隆為第七區(qū)。
1956年6月，涪陵縣鴨江、送月、廟埡、鳳來(lái)4個(gè)鄉(xiāng)劃入武隆縣，由武隆縣笫六區(qū)（平橋區(qū)）管轄。
1957年4日，武隆縣成立鴨江區(qū)，轄鴨江、送月、鳳來(lái)、廟埡、里仁5個(gè)鄉(xiāng)。
1976年7月，為修建文復(fù)公社沙壩水庫(kù)，解決庫(kù)區(qū)占地問(wèn)題，經(jīng)江口區(qū)、文復(fù)公社與彭水縣漢葭區(qū)、火石公社協(xié)商，彭水縣火石公社東山大隊(duì)4個(gè)生產(chǎn)隊(duì)劃屬文復(fù)公社。
至此始形成武隆縣行政區(qū)劃規(guī)模。
1958年后，全縣區(qū)劃多次進(jìn)行調(diào)整。
1988年底，設(shè)8個(gè)區(qū)，2個(gè)鎮(zhèn)、50個(gè)鄉(xiāng)。
1992年9月，撤區(qū)并鄉(xiāng)，新建6個(gè)鎮(zhèn)，擴(kuò)大2個(gè)鎮(zhèn)、7個(gè)鄉(xiāng)，保留17個(gè)鄉(xiāng)。
1995年10月，再撤2個(gè)鄉(xiāng)設(shè)鎮(zhèn)，同時(shí)恢復(fù)原5個(gè)鄉(xiāng)。
1998年11月，又恢復(fù)以前撤并的8個(gè)鄉(xiāng)，年末共為8鎮(zhèn)、32個(gè)鄉(xiāng)。
2002年6月，撤1鄉(xiāng)設(shè)鎮(zhèn)。
2003年10月，再將原有的11個(gè)鎮(zhèn)、35個(gè)鄉(xiāng)調(diào)整為11個(gè)鎮(zhèn)、15個(gè)鄉(xiāng)。
2009年，將4個(gè)鄉(xiāng)劃定為少數(shù)民族鄉(xiāng)，同時(shí)又撤1鄉(xiāng)建鎮(zhèn)。
2016年11月24日，國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)武隆撤縣設(shè)區(qū)。
12月2日，重慶市四屆人大常委會(huì)召開(kāi)第三十次會(huì)議，審議通過(guò)《重慶市人民代表大會(huì)常務(wù)委員會(huì)關(guān)于梁平縣武隆縣撤縣設(shè)區(qū)有關(guān)事項(xiàng)的決定》，決定設(shè)立武隆區(qū)人民代表大會(huì)。
12月20日，武隆撤縣設(shè)區(qū)干部大會(huì)召開(kāi)。
2017年1月13日，重慶市武隆區(qū)正式成立，區(qū)人民政府仍駐巷口鎮(zhèn)。
2017年12月1日，經(jīng)重慶市人民政府批準(zhǔn)同意，撤銷(xiāo)巷口鎮(zhèn)，以烏江為界設(shè)立鳳山街道和芙蓉街道。
2020年4月22日，經(jīng)重慶市人民政府批準(zhǔn)同意撤銷(xiāo)羊角鎮(zhèn)、土坎鎮(zhèn)，設(shè)立羊角街道；同意撤銷(xiāo)仙女山鎮(zhèn)，設(shè)立仙女山街道；同意撤銷(xiāo)鳳來(lái)鄉(xiāng)，設(shè)立鳳來(lái)鎮(zhèn)。