1955年屬煙墩區(qū)建設(shè)鄉(xiāng)。
1956年后屬曉星鄉(xiāng)。
1958年為曉星管理區(qū)黃港大隊。
1961年曉星管理區(qū)分為大圩、曉星兩個公社，慈云大隊由黃港大隊分出，屬大圩人民公社。
1968年大圩、曉星兩公社合并成立東方紅人民公社，慈云大隊屬之。
1972年大圩、曉星兩公社再次分開，慈云大隊又劃為大圩公社管理。
1978年劃歸合肥市郊區(qū)。
1983年為大圩鄉(xiāng)慈云村。
1992年大圩、曉星兩鄉(xiāng)再次合并為大圩鄉(xiāng)。
2007年屬大圩鎮(zhèn)至今。